9×01 – Avalon (parte 1)
El Teniente Coronel Cameron Mitchell llega al Comando Stargate para ser el nuevo miembro del SG-1, pero pronto descubre de la mano del General Hank Landry (el sucesor de O’Neill) que el equipo se ha dispersado. Carter está en el Área 51, Daniel se encuentra a punto de viajar a Atlantis y Teal’c ha vuelto con su gente. Vala llega a la Tierra con una tabla que supuestamente les dirá la ubicación de un tesoro Antiguo y Mitchell decide que encontrarlo puede ser la ocasión perfecta para reunir al SG-1.
9×02 – Avalon (parte 2)
Daniel Jacson y Vala son aparentemente transportados a los cuerpos de dos personas de una galaxia lejana en un planeta poblado por trabajadores fieles a una extraña autoridad.
9×03 – Origen
El comando Stargate encuentra misioneros de una raza de "dioses" conocidos como los Ori, que no toleran a los infieles.
9×04 – Lazos que unen
Con el fin de liberarse del vínculo creado por los brazaletes Jaffa, Daniel y Vala deben localizar y devolver los objetos que ella robó al antiguo dueño de los brazaletes.
9×05 – Los que detentan el poder
El SG-1 y Vala van a un planeta donde ella todavía es venerada como qetesh y, para probar a la gente que los Ori no son verdaderos dioses ella les cuenta toda la verdad. Sin embargo, esto hace que ella sea obligada a tener un juicio y, posiblemente, a ser equecutada.
9×06 – Cabeza de playa
Cuando los Ori crean un campo de fuerza alrededor de un planeta Jaffa libre, el General Landry ordena a Carter que use un arma que ella misma ha diseñado contra los Ori.
9×07 – El dios clonado
Un señor del sistema es encontrado escondiéndose en la Tierra y amenaza con activar una bomba de naquadah escondida en alguna parte de los Estados Unidos si tratan de ir tras de él.
9×08 – Babilonia
El SG-1 es atacado por un Jaffa de los Sodan y Mitchell es herido en una pelea con uno de ellos. Pensando que el Jaffa fue asesinado, otra Jaffa lleva a Mitchell a su poblado para ser entrenado para un duelo a muerte.
9×09 – Prototipo
El SG-1 encuentra un híbrido humano-Goa’uld congelado abandonado en un laboratorio y lo llevan a la Tierra para estudiarlo, donde descubren que ha sido creado utilizando el ADN de Anubis.
9×10 – El Cuarto Jinete (parte 1)
El Comando Stargate regresa a la Tierra después de ser infectados por una plaga de los Antiguos. El virus que han traido se propaga rápidamente por los Estados Unidos. Por otra parte, para evitar que los Ori consigan el control de toda la Vía Láctea, Orlin desciende una vez más para ayudar a Carter a encontrar una cura.
9×11 – El Cuarto Jinete (parte 2)
Los miembros del Comando Stargate empiezan a verse infectados mientras Mitchell y Daniel tratan de capturar al Prior.
9×12 – Daño colateral
Cuando el SG-1 viaja a un planeta protegido por los Asgard, el Coronel Mitchell es acusado de un asesinato que no ha cometido… pero los recuerdos le muestran que sí lo hizo.
9×13 – Onda expansiva
Realidades alternativas se dan encuentro en el Comando Stargate para crear distintas versiones del SG-1, junto con alguno de sus aliados ya caídos.
9×14 – Fortaleza
Ba’al asesina y lava el cerebro de los miembros del Consejo Superior Jaffa en un intento de conseguir el control de los Jaffa. Mientras tanto, Mitchell se pregunta si revelar el programa Stargate a un viejo amigo moribundo.
9×15 – Ethon
El SG-1 y el Prometeo viajan a Tegalus para evitar que el Protectorado Rand utilice un arma proporcionada por los Ori para destruir a su enemigo, la federación Calcedonia. Pero las cosas se tuercen cuando Daniel es capturado y el Prometeo es cogido en un tiroteo.
9×16 – Fuera de la red
El Comando Stargate descubre que la organización de comerciantes y mercenarios conocida como la Alianza Lucian está distribuyendo drogas altamente adictivas y el SG-1 va a investigar. Pero la situación se vuelve complicada cuando el Stargate del planeta desaparece, y el SG-1 es acusado de ser responsable.
9×17 – La plaga
Mientras un grupo de delegados del IOA visita la base de investigaciones Gamma, un enjambre de insectos alienígenas relacionados con los Ori escapa de su confinamiento… y se han vuelto carnívoros.
9×18 – El manto de Arturo
Carter y Mitchell se encuentran atrapados en otro plano, fuera de fase e invisible a todos los demás. Mientras Sam intenta sacarles de esa sitiuación, Mitchell va detrás de un asesino que está acabando con los Sodan.
9×19 – Cruzada
Usando un dispositivo de comunicación Antiguo, Vala contacta con el Comando Stargate a través de Daniel y les informa de lo que está ocurriendo en la galaxia de los Ori.
9×20 – Camelot
El equipo descubre un sistema de armamento Antiguo en el pueblo de Camelot, en un planeta alienígena.
